本发明公开了一种基于灰度统计及区域编码的SAR图像水域识别方法，它属于SAR图像处理技术领域。主要解决了现有技术难以区分水域与低灰度的植被和路网的问题。其实现步骤为：先对图像进行像素灰度归一化处理，然后利用本发明确定的灰度经验阈值将图像像素归类为目标区和非水域，再计算归类处理后图像中的连通区域面积以消除小面积的非水域，最后通过跑长读取剩余目标区的编码，根据读取的区域编码消除间断性的植被和路网非水域，最终识别出真实水域。本发明能够有效地解决SAR图像水域识别对噪声敏感，低灰度植被和路网难以区分的问题，具有良好快速的识别效果，可用于河流和湖泊的识别及水上目标的检测。